医学生物实验学分中心是基础医学国家级实验教学示范中心的三个分中心之一，也是江苏省实验教学省级示范中心—医学生物化学与分子生物学实验教学示范中心。实验中心全面整合了原分散于生物化学与分子生物学和化学教研室中的实验室、仪器、实验技术人员等各项资源，实现了实验中心的“统一管理、统筹规划、资源共享、有效利用”的运行机制。
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实验中心的实验教学坚持“夯实基础、强化能力、激发创新”为理念，面向临床医学、麻醉学、口腔医学、急救医学、预防医学、影像学、护理学生物科学等25个专业的本科生、留学生及研究生开设生物化学、分子生物学、蛋白质工程、酶工程、蛋白质组学、遗传学、和无机化学、有机化学等八门实验课程，年实验学生人数近5000人，年均课时数7500学时左右，完成的实验课教学人时数达18.08万人/年。实验中心拥有实验教学用房2472平方米，设有多媒体教学实验室12间，拥有核酸及蛋白质分离纯化系统、梯度PCR仪、台式高速离心机、荧光倒置显微镜系统、超微量全波长分光光度计、二氧化碳细胞培养箱等较为先进的教学仪器736件，实验室固定资产约419万元。
实验中心构建“层次化、模块化、开放化”的创新能力培养体系，开设验证性实验、综合性实验、探究性实验三个层次的实验项目，并依托生物化学与分子生物学省级重点学科的科研优势，以科研促教学，不断促进实验教学内容的改革与创新；根据能力培养层次、专业群共性及个性化需求，将实验内容重组为独立且可灵活组合的教学单元，实现不同专业实验的模块化教学。实验中心设有大学生科研创新实验平台，实行预约制开放，课余时间、周末及假期均向获得准入资格的学生开放，配备专职实验教师和研究生助教进行安全巡视与技术答疑，面向大学生创新创业训练计划、全国基础医学创新研究暨实验设计论坛等赛事，提供从选题指导、实验方案论证、试剂耗材供应到仪器使用、数据分析和论文撰写的一站式孵化服务。